Directeur de recherche à INRAE et spécialiste du microbiote, Hervé Blottière nous en explique les enjeux.
En quoi consistent Le French Gut et sa version Kids ?
Nous savons aujourd’hui que la richesse et la diversité de notre microbiote intestinal (50 000 milliards de micro-organismes en moyenne) sont un déterminant majeur de notre santé. Toutefois, pour mieux comprendre comment celui-ci est influencé par nos modes de vie, par notre alimentation ou par nos pathologies, nous avons besoin de plus de don- nées. C’est pourquoi, depuis 2023, nous faisons appel à la population pour obtenir des échantillons de selles, que nous analysons en laboratoire. Pour compléter ces données, nous avons lancé fin 2025 un volet spécifique qui doit nous permettre de mieux comprendre comment le microbiote évolue durant l’enfance et l’adolescence : Le French Gut Kids.
Pourquoi est-ce un volet important de votre étude ?
Nous avons aujourd’hui une bonne connaissance du développement du microbiote dans les premiers moments de la vie, et des facteurs qui l’influencent : mode d’accouchement, type d’alimentation, exposition à certains médicaments… Mais alors que nous pensions qu’à l’âge de 3 ans les enfants avaient déjà un microbiote proche de celui des adultes, de nouvelles études ont montré que ce n’était pas le cas et qu’ils possédaient des entérotypes (profils de microbiote) particuliers. Ici aussi, nous avons besoin de plus de données pour avoir une vision claire de la façon dont l’alimentation, le mode de vie, les maladies, la puberté ou encore l’exposition aux pesticides et aux polluants impactent le microbiote des plus jeunes. Toutes ces informations vont nous permettre de renforcer nos connaissances, et d’améliorer nos recommandations, par exemple sur l’activité physique, dont on pense qu’elle contribue à un microbiote sain.
Comment le microbiote influence la santé des enfants ?
On sait qu’un microbiote déséquilibré, insuffisamment riche et diversifié, peut contribuer à l’apparition de nombreuses maladies inflammatoires chroniques, au surpoids et à l’obésité, au diabète de type 1 ou 2… ou encore à des troubles de la santé mentale, avec un lien intestin-cerveau désormais bien documenté. C’est dans ce contexte, où la santé mentale des jeunes se dégrade, que notre étude est d’autant plus importante.
Comment favoriser un microbiote riche et diversifié ?
L’éducation à l’alimentation devrait commencer dès le plus jeune âge, car elle est clé pour un microbiote en bonne santé, et plus efficace auprès des enfants que les interdictions. Il faut manger beaucoup d’aliments riches en fibres (comme les légumineuses) pour atteindre 35 grammes par jour. À l’inverse, il faut limiter les produits ultratransformés (comme les céréales petit déjeuner), ainsi que ceux trop gras et trop sucrés. Pour faire manger plus de fruits et de légumes aux enfants, on peut par exemple miser sur les couleurs. Associer des végétaux de couleurs différentes permet d’avoir un apport plus diversifié en vitamines, ainsi qu’en polyphénols. Ces derniers nourrissent chacun un type de bactéries différent, ce qui contribue au bon équilibre du microbiote. Sur le plan médical, il faut également veiller à ne donner des antibiotiques aux enfants que lorsque c’est nécessaire, car ils peuvent impacter la richesse du microbiote intestinal.
Comment participer à l’étude Le French Gut Kids ?
Toutes les informations sont en ligne sur lefrenchgut.fr, dans l’espace Kids. Tous les enfants peuvent participer, où qu’ils habitent en France et quel que soit leur état de santé. Après avoir rempli un questionnaire en ligne, un kit de prélèvement vous sera envoyé par voie postale, accompagné des instructions pour la collecte. C’est simple, rapide, et cela fait avancer la recherche.
Crédit illustration : Getty Images/fStop
